Furukawa Nagisa egy év kihagyás után tér vissza az iskolába, és próbál beilleszkedni, miközben barátokat szerez. Tomoya Okazaki, aki nem kedveli sem az iskolát, sem a várost, segít neki, amikor együtt ebédelnek, és javasolja, hogy csatlakozzon egy szakkörhöz. Miután a színjátszó kör már megszűnt, úgy döntenek, hogy sajátot alapítanak. A történet során más karakterek is megjelennek, és a színjátszó kör megalapítása csak az alapja a fejlődő kapcsolatoknak. A történet főleg a két főszereplő, Tomoya és Nagisa közötti változásokra és fejlődésükre összpontosít, miközben más események is kibontakoznak, mint például egy szellem lány megjelenése.